學校初名北洋醫(yī)學堂，1894年創(chuàng)辦于天津，是中國近代第一所官辦西醫(yī)院校。1913年改稱直隸公立醫(yī)學專門學校，1915年由天津遷至保定，1921年與他校合并，稱河北大學醫(yī)科；1932年河北大學解散，醫(yī)科獨立建校，改稱河北省立醫(yī)學院，1937年學校停辦，1946年河北省立醫(yī)學院于保定復校，1947年遷回天津；1949年改稱河北醫(yī)學院，1952年再遷保定，1958年遷至石家莊。1970年天津中醫(yī)學院并入河北醫(yī)學院，改稱河北新醫(yī)大學；1979年恢復河北醫(yī)學院校名；1995年，由河北醫(yī)學院、河北中醫(yī)學院、石家莊醫(yī)學高等專科學校合并組建河北醫(yī)科大學；2009年原石家莊衛(wèi)生學校并入，2013年河北中醫(yī)學院恢復獨立建制，學校沿用河北醫(yī)科大學校名。